1956年9月，省委決定籌建江西省科學院。1958年4月，決定將原定的“江西省科學院”名稱改為“中國科學院江西分院”，下設物理研究所、應用物理研究所、計算技術研究所、應用化學研究所、計量管理研究所、山區病害防治醫療研究所、機械化半機械化研究所、廬山植物研究所、煤炭綜合利用研究所、人工控制天氣研究所和湖泊研究站等11個研究所（站），并附設了一批科學試驗工廠，在編人員970余人。后因機構調整，部分研究所劃入中國科學院華東分院，其余機構劃歸省屬其它單位。

1979年7月20日，省委印發《關于成立江西省科學院的通知》。1979年9月1日正式恢復建院，成為直屬于江西省人民政府的自然科學綜合研究機構。

現有青山湖、艾溪湖兩個院區，設有生物資源研究所、微生物研究所、能源研究所、應用物理研究所、應用化學研究所、科技戰略研究所6個研究所和江西省產業技術研究院，以及一批新型研發機構（省級3個）。目前在崗職工550余人，高級職稱180余人，博士200余人。建有國家國際科技合作基地、國家級科技企業孵化器、國家級眾創空間、國家級小微企業創新創業示范基地等6個國家級基地，銅基新材料江西省重點實驗室、溫室氣體核算與碳減排江西省重點實驗室、工業水污染防治江西省重點實驗室、特色果樹茶葉種植與高值利用江西省重點實驗室、江西省藥食同源植物功效成分提取與高效利用工程實驗室、江西省稀土催化材料工程研究中心等21個省部級研發平臺和1個省級智庫。江西省人民政府與中國工程院共建的中國工程科技發展戰略江西研究院依托我院建設運行。在新材料、新能源、低碳技術、生物化工、天然產物化學、現代農業、科技智庫等領域具備鮮明的優勢。

近年來，獲得?。ú浚┮陨溪剟?00余項、專利600余項，發表高水平論文論著1200余篇（部），擁有省級以上各類人才70余人，實現科技成果轉化300余項。牽頭組織的鄱陽湖多學科綜合科學考察，其成果獲得國家科技進步獎二等獎；參與的“中國動物志扁形動物門吸蟲復殖目”獲得國家自然科學獎三等獎?！?/span>數字陶瓷設計關鍵技術研發及應用”“綠原酸萃取與多相重結晶精制工藝研究”“鵝掌楸屬種質資源收集、保存與良種選育及應用推廣”等6項成果獲得省科技進步一等獎，“江西省縣域科技創新能力評價報告（2018、2019年度）”等3項成果獲省社會科學優秀成果獎一等獎。

潮平兩岸闊，風正一帆懸。進入新時代新征程，江西省科學院堅持以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，深入學習貫徹落實黨的二十大精神，大力弘揚科學家精神，愛國奉獻、求實創新，永葆家國情懷，勇攀科技高峰，為實現高水平科技自立自強、奮力譜寫中國式現代化江西篇章作出新的更大貢獻。